Cluster report for all.human.fasta.clus
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Cluster
Size Frequency Unique Primary Name
1 -- 26973
2 -- 6861
3 -- 3353
4 -- 2218
5 -- 1631
6 -- 1353
7 -- 1086
8 -- 987
9 -- 821
10 -- 777
11 -- 653
12 -- 563
13 -- 526
14 -- 493
15 -- 445
16 -- 414
17 -- 356
18 -- 295
19 -- 308
20 -- 251
21 -- 208
22 -- 220
23 -- 196
24 -- 185
25 -- 161
26 -- 159
27 -- 119
28 -- 136
29 -- 103
30 -- 101
31 -- 81
32 -- 79
33 -- 82
34 -- 74
35 -- 59
36 -- 63
37 -- 42
38 -- 58
39 -- 58
40 -- 54
41 -- 37
42 -- 25
43 -- 43
44 -- 40
45 -- 30
46 -- 29
47 -- 21
48 -- 20
49 -- 13
50 -- 14
51 -- 13
52 -- 23
53 -- 15
54 -- 14
55 -- 10
56 -- 11
57 -- 18
58 -- 19
59 -- 14
60 -- 9
61 -- 14
62 -- 12
63 -- 10
64 -- 6
65 -- 5
66 -- 6
67 -- 5
68 -- 9
69 -- 9
70 -- 5
71 -- 7
72 -- 7
73 -- 7
74 -- 5
75 -- 9
76 -- 13
77 -- 5
78 -- 5
79 -- 6
80 -- 7
81 -- 6
82 -- 4 M64098 NM_002629 BC020236 BC000163
83 -- 5
84 -- 8
85 -- 3 BC015869 BC001271 NM_001970
86 -- 4 NM_000820 BC000771 NM_006367 AF070561
87 -- 3 BC016759 BC000522 BC010240
88 -- 2 NM_005063 NM_000362
89 -- 3 NM_001886 NM_001728 NM_000701
92 -- 4 BC005159 UI-H-DF0-beq-p-14-0-UI.s1 NM_007085 BC016381
93 -- 5
94 -- 3 NM_004999 UI-1-BC0-afn-g-04-0-UI.s2 BC014654
95 -- 2 D14696 BC011460
97 -- 2 NM_003900 UI-H-EZ0-baw-f-01-0-UI.s1
98 -- 6
101 -- 2 NM_004530 NM_002084
102 -- 3 UI-H-FT1-bht-g-09-0-UI.s1 NM_001753 NM_003479
104 -- 1 NM_001288
105 -- 1 NM_000516
106 -- 2 NM_000515 BC026229
107 -- 2 NM_002725 BC007252
108 -- 1 UI-CF-EN1-acs-d-07-0-UI.s1
109 -- 2 NM_004396 NM_002574
110 -- 4 J03517 NM_000095 NM_003011 NM_001909
111 -- 2 UI-H-EI0-ayl-f-05-0-UI.s1 UI-H-EI0-ayl-a-24-0-UI.s1
112 -- 1 UI-H-EZ1-baz-k-13-0-UI.s1
113 -- 2 AK001336 BC013187
116 -- 6
117 -- 1 NM_004500
118 -- 3 M14083 NM_000041 UI-H-FH0-bcc-b-19-0-UI.s1
120 -- 1 UI-H-EU0-azm-g-10-0-UI.s1
121 -- 1 BC000916
122 -- 1 UI-H-DT0-avi-c-22-0-UI.s1
125 -- 3 M23613 UI-1-BC0-afn-d-10-0-UI.s2 BC000529
126 -- 1 BC000449
128 -- 1 UI-H-FH0-bcc-o-04-0-UI.s1
130 -- 1 UI-H-FL0-bdh-h-17-0-UI.s1
131 -- 2 AF052179 AL096746
133 -- 3 BC002411 UI-H-EZ1-bba-a-08-0-UI.s1 AF218029
135 -- 2 NM_006009 UI-H-FG0-bdg-f-06-0-UI.s1
136 -- 1 UI-H-DF0-bev-f-01-0-UI.s1
138 -- 3 M16660 J00194 UI-H-DF0-bep-p-24-0-UI.s1
139 -- 2 NM_000365 NM_000972
140 -- 1 BC000097
141 -- 2 BC003510 UI-H-FL1-bge-o-08-0-UI.s1
143 -- 3 UI-HF-EL1-awk-i-01-0-UI.s1 BC000481 NM_001010
144 -- 1 BC004927
146 -- 1 NM_006013
148 -- 1 AF284768
150 -- 1 NM_003299
151 -- 1 NM_001007
152 -- 1 NM_001743
155 -- 2 NM_002023 BC004532
156 -- 1 NM_013336
157 -- 1 BC000672
164 -- 2 NM_001711 AF178986
166 -- 1 AF028832
172 -- 2 M32294 NM_001317
173 -- 2 NM_000700 M60255
181 -- 1 NM_006026
187 -- 1 L20941
188 -- 1 NM_000970
195 -- 1 BC001128
200 -- 1 UI-1-BB0-abw-h-01-0-UI.s2
206 -- 1 NM_001006
209 -- 1 NM_006597
218 -- 2 NM_001901 BC010054
233 -- 1 NM_012423
237 -- 1 NM_000088
239 -- 2 NM_001404 UI-H-FL0-bdq-m-07-0-UI.s1
248 -- 1 NM_001428
250 -- 1 NM_000967
252 -- 1 NM_000090
272 -- 1 NM_001614
277 -- 1 UI-CF-EC1-aeb-o-12-0-UI.s1
305 -- 1 NM_001002
314 -- 2 UI-H-DF0-bex-g-21-0-UI.s1 UI-CF-DU1-abd-j-08-0-UI.s2
325 -- 1 AY007153
331 -- 1 D00017
352 -- 1 NM_001101
359 -- 1 BC004319
364 -- 1 UI-H-DF0-bey-p-14-0-UI.s1
378 -- 1 UI-H-FE0-bby-i-22-0-UI.s1
379 -- 1 NM_001920
405 -- 1 NM_000089
416 -- 1 NM_000146
436 -- 1 NM_024895
458 -- 1 NM_003118
494 -- 1 M64722
620 -- 1 UI-H-EU0-azn-p-20-0-UI.s1
1182 -- 1 NM_001402
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Total # sequences = 289552
Total # redundant = 236207
Total # clusters = 53345
With respect to this cluster file only:
Novelty = 18.42%
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Avg Similarity = 96.47%
Avg Primary Alignment = 1407
Avg Secondary Alignment = 402
Avg Match Length = -61
Last Modified: Thu Nov 21 12:39:45 2002